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ヒロクリニック独自の高精度オリジナル検査
イルミナ社とMedicover社の技術を組み合わせた当院唯一の検査結果をご提供いたします
ヒロクリニックには知的障がいプランとベーシックプランがあります。その違いは精度の高いMedicover式を使っているかどうかということです。NIPTもさまざまな方式があり、その精度は違います。特に最近開発された微小欠失症候群（指定難病検査）などの小さな欠損を検出するにはMedicover式の技術が必要になります。ヒロクリニックでは提携している東京衛生検査所と共同で検査結果を検証しています。
| 知的障がいプラン | ベーシックプラン | |
|---|---|---|
| 検査手法 | Medicover式 | Illumina式 |
| 検査深度 | 100倍 | 0.3倍 |
| 検査精度 | 0.5Mbまで | ７Mb |
| SNPの検出（15万以上） | 可能 | 不可能 |
| FFの正確性 | 優（SNPの利用） | 並 |
両者の間でもっともちうのがシークエンスの際の読み込み深度です。一例としてディジョージ症候群に関係する部分の読み込みを見てみます。上が知的障がいプランです。下がベーシックプランです。青の縦軸が高いほど読み込み深度が深くなっています。イルミナ式はどこの場所でも基本的に同じ深さで読んでいます。そのため、深さが出ないのです。試薬の分量は同じなため、広く読むと浅くなってしまいます。
そのため、ベーシックプランでも７Mbの大きさまでの部分欠失重複であれば問題ないのですが、それ以下になると難しいです。7Mbと言われてなかなかわからないと思います。以下に棒グラフをつけますが、21番染色体で46Mbのサイズです。イルミナ式の検査深度が0.3倍でも21、18、13染色体の検出であれば問題はないのです。
しかしながら、この技術のままでは微小欠失を捉えることができません。一番小さくかつ頻度の高いディジョージ症候群（指定難病203）では３Mb以下の欠失が90％以上です。イルミナ式では検出できません。海外で検査をしている微小欠失症候群検査（イルミナの検査）はこちらの手法を使っています。
別のページでも説明しましたが、イルミナ国外検査ではFF(Fetal fraction)10％未満では陽性のものが陰性になってしまうのです。
また、ベーシックタイプではFFが正しく出ない可能性があります。ここが正確に検出できないと結果がぶれます。イルミナは胎児のcfDNAの長さの違いから統計的にFFを推定していますが、Medicover式はSNPをつかって計測しています。SNPは個人個人違う情報を持っている遺伝子情報であり、父親からもらった胎児のDNAを測ることによってFFを正確に検出することができます。ただ正確に読み込むには最低でも30倍以上の深さが必要になります。そのためMedicover式では読む範囲を狭くして深く読むようにしています。これによってFFが深く読むことができます。東京衛生検査所で測定した両者のFFをグラフにします。これは同一の患者でIllumina方式とMedicover方式がどれほど違うかを示しています。
同一であれば赤の線上に近いところに並ぶはずですが、ばらつきがあります。ばらつき具合を表す相関係数rが1に近づけば同一いうことですが、0.83と精度は完全ではありません。
FFを正しく読むということは胎児と母親の遺伝子を区別するということです。この技術を使うと双胎児の精度が格段に上がります。エコー状で一人の胎児であってもバニシングツインのことがあります。（バニシングツインとはもともと二人の胎児だったものが、一人消失してしまう状態です。）NIPT検査を行うと遺伝子情報からバニシングツインと診断されることもあります。エコー検査をするときにはすでに小さくなっていて見えないことがあるのですが、遺伝子検査でもこれが影響を受けます。この状態であっても、知的障がいプランでは検出することが可能です。
では,Medicoverも完璧かというとそういうことではありません。深いのですが範囲が狭いのです。
なので両者を組み合わせることができれば、死角はかなりなくなります。そこで我々が考えたのは知的障がいプランの中でもFM,GMプランです。両者を組み合わせて正確かつ、広い範囲の検査を可能にしています。下の図の赤いところがGMプラン、緑のところがFMプランです。今回は常染色体劣勢遺伝子検査(+)の話を割愛しますが、これもMedicover検査の一つです。
FM+ほとんどの領域をカバーすることができています。また、生存期間の長いケースをカバーしているのが、GMプランとなります。いずれも知的障がいプランを行うことによってNIPTで検出できるほぼすべての検査を行うことが可能になります。
2つの検査システムの組み合わせの利点
イルミナ（ベリナタ）社とMedicover社のシステムは、それぞれが高い検査精度を誇りますが、両者を組み合わせることで、さらに精度の高い結果を得られるという大きな利点があります。ヒロクリニックでは、BMプラン、GMプラン、FMプランで検査を提供しており、これらの組み合わせを通じて、13、18、21番染色体及び性染色体がカバーされています。イルミナ社は全染色体を広範に調査し、Medicover社は特定の範囲に絞り込むことで、細かな微小欠失を含む詳細な検査が可能です。特に、双子の場合はMedicover社の検査が優れているため、両社を組み合わせることは様々なシナリオで検査の精度向上に寄与しています。もし、2つの検査で異なる結果が出た場合、我々は総合的な評価を行い、陽性スコアを加味して最終的な判断を下します。これにより、単一のシステムでは見逃されるかもしれない微細な違いまで捉え、より正確な診断を提供することが可能になります。
東京衛生検査所によるNIPT検査報告書サンプル
実際のNIPT報告書サンプル
東京衛生検査所が医療機関に提供するNIPT検査の陰性報告書を、ご紹介します。東京衛生検査所では、NIPT検査を行うために、イルミナ社とメディカバー社の検査手法を導入しています。イルミナ社とメディカバー社はどちらもNIPT検査が可能ですが、それぞれ検査可能な範囲が違います。東京衛生検査所では両社の特性や可能な検査を見極めて適切に検査手法を使い分けています。こうして東京衛生検査所は最新技術に基づいた精密な分析・結果を通じて、医療機関から受験者様に安心を提供しております。
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【イルミナ社の機器によって検査をした際の結果報告書】(陰性）
※実際に東京衛生検査所で作成している検査結果報告書のサンプル
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【メディカバー社の機器によって検査をした際の結果報告書】（陰性２）
※実際に東京衛生検査所で作成している検査結果報告書のサンプル
①FF(Fetal fraction) 胎児のcfDNAの割合
②陽性時には赤で表示されます。
③陽性的中率
妊婦さんの妊娠週数と年齢から算出されます。遺伝子情報と関係はありません。
④陽性スコア
どれだけ正常値から離れているかがわかる数値です。陽性の度合いがわかります。
※イルミナとメディカバーで結果が違うことがあります。
※Early検査では1回目と2回目で検査が異なることがあります。
【イルミナ社の機器によって検査をした際の結果報告書】(陽性1）
21番トリソミー
【イルミナ社の機器によって検査をした際の結果報告書】(陽性2）
21番トリソミー（陽性スコア低値）
【イルミナ社の機器によって検査をした際の結果報告書】(陽性3）
21番トリソミー（陽性スコア低値）
【メディカバー社の機器によって検査をした際の結果報告書】(陽性1）
21番トリソミー
【メディカバー社の機器によって検査をした際の結果報告書】(陽性2）
21番トリソミー
【メディカバー社の機器によって検査をした際の結果報告書】(陽性3）
21番トリソミーボーダーライン
NIPTの解説概要
NIPT説明文書(Genomewide screens)
この検査は、性染色体の異数性だけでなく、全ての常染色体の異数性、部分的な重複や欠失も検出可能です。特に21トリソミー、18トリソミー、13トリソミーを含む主要な染色体異常に対して、特異度99%で検証されていることがこの報告書で強調されています。
検査方法
NIPTの実施は、採血後、血漿からcfDNAを抽出し、次世代シーケンシング技術を用いて解析を行います。この高度なプロセスは、イルミナ社の先端的な解析技術により支えられています。
検査の限界と注意事項
検査には限界があり、単胎および双胎妊娠でのデータに基づいていますが、多胎妊娠では検証されていません。また、検査結果は他の医療情報と組み合わせて考えることが重要です。陽性または陰性の結果についても、羊水検査などの追加的な診断手順が必要になる場合があります。
検査結果の解釈
「陰性」という結果は、検査対象の染色体が正常なコピー数を持っていることを示します。もしも染色体異常が検出された場合は、具体的な状況とともに詳細なガイダンスが提供されます。
東京衛生検査所のNIPT報告書は、医療技術と緻密な検査プロセスを通じて、医療機関へ提供されております。また、医療機関の先にある受験者様一人ひとりの健康と安心、未来を守るために日々尽力しています。この報告書から、受験者様と医療機関は有益な情報を得て、より良い医療決定を支援することができると考えています。
検査結果の確認とセキュリティ
ヒロクリニックが提供する検査結果には、受検者様専用のQRコードが付随しています。このQRコードには、受検者様の重要な情報が含まれており、検査所とクリニック間で情報の正確性と安全性を確保しています。この厳格なチェック体制により、受検者様と医療提供者双方に安心と信頼を提供しています。
精度向上のためのアプローチ
ヒロクリニックでは、検査結果を単に数値として扱うのではなく、検査結果の背後にあるデータを深く掘り下げます。イルミナ社とMedicover社からの結果が異なる場合、検査所の専門家と医師が共同で検査技術の特性と受検者様の状況を考慮しながら結果を討論し、各ケースを詳細且つ慎重に分析します。ただし、稀なケースでは、NIPTの結果が得られないことがあります。これは、検査の技術的制限や母体・胎児の特殊な状況によるものです。例えば、胎児のDNAが検出できる量が不足している場合や、母体の体質によって血液中のDNAが不十分な場合などが考えられます。このような場合は羊水検査に進んでより確実な結果を得る、さらには両親の遺伝子検査を行った方がよい場合もあります。
このように様々な状況を鑑みながらプロセスを通じて、検査結果の精度をさらに高め、受検者様に最も正確な情報を提供します。
ヒロクリニックは検査精度が低いのか？
上記のような批判を受けることが時々あります。それどころか、悪意を持って書いているWEBサイトまであります。なので、ここで反論をしてみたいと思います。
もともと日本で使っているシークセンサーは何種類あると思いますか？
答えは4種類です。
| 種類 | 国内検査 |
|---|---|
| Veriseq V2システム | 東京衛生検査所、平石クリニック、日本遺伝子医学株式会社 |
| MassARRAY QGE + Sequenom | GeneTech株式会社 （認証施設のほとんどはここに出しています） |
| パーキンエルマー | Riz Medical（関西） |
| Medicover式（キプロス） | 東京衛生検査所 |
平石クリニックはDNA先端医療株式会社と同じものを使っているので、精度は東京衛生検査所と変わりません。日本遺伝子医学株式会社はNIPT認証施設の検査所です。山王病院、国際医療福祉大学を顧客に持っています。最近ではGeneTechもVeriseq V2システムを使い始めたようです。迅速に結果がでることと安定しております。
ヒロクリニックは東京衛生検査所なので上記と同じものを使っています。ですので精度に差が出るはずがないのです。完全にプロトコールが決まっているので、間違いが起こりません。
特筆すべきは東京衛生検査所はMedicover式の技術移転を受けているためにこの方式で検査を国内で検査することが可能です。この方式の優れたところは胎児の種別を認識できるので、バニッシングツインや代理母にも対応できることです。また、4種類の微小欠失症候群を検出できるのは国内でこの方式となります。両方の方式を利用した検査を受けることができるので、その場合には異なる方式の検査結果を受け取ることができ、多くの項目を比較することができます。ちなみにミネルバクリニックはMedicover社に外注で出しています。
なので、ヒロクリニックが特に精度が低いというあやまった考え方はありえないというのが、会社としての意見です。
手前味噌でございますが、我々はすでに64,000件を超える検査を自社グループ内で行っています。このデータは生データであり、そのデータをつかって最適な検査の選択をお手伝いできると思っています。また、NIPT検査のデータと羊水検査のデータをリンクさせ、陽性度合いの検出した陽性スコアを輩出しているのは、ヒロクリニックだけです。機械は同じであってもそこから得られる解析方法に我々は自負しております。
ご理解いただけることを願っています。
