全常染色体全領域部分欠失・重複疾患とは

染色体の一部が欠けてしまった状態を「欠失：deletion」、一部が増えた状態を「重複：duplication」とよびます。東京衛生検査所の次世代シーケンサーでは700万塩基（7Mb）以上の欠失、重複があった場合に検査結果としてご報告しています。

微小欠失疾患は100万塩基から300万塩基程度の欠失でも症状を発症しますが、症例によっては当該遺伝子を含んで700万塩基以上の欠損を伴うこともあります。疾患特有部位の遺伝子欠損を超える大きな欠失があった場合も、該当遺伝子が欠損しているために同様の症状またはより重度の疾患を伴うことが考えられます。そのため、該当欠損部位が疾患特異的部位にふくまれている場合、欠損範囲が大きい場合でも同じ診断名をつけるのが妥当と我々は考えております。微小欠失と呼ぶと誤解を招くため、当サイトでは「部分欠失疾患」として記載させていただきます。

欠失や重複は、その部分に存在している遺伝子がどのような働きを持っているかによって様々な症状が見られます。例えば、ある種の酵素を作り出す遺伝子を含む染色体が欠損した場合は酵素の欠損症が見られ、骨の形成を司る遺伝子を含む染色体が重複した場合は骨形成の異常が認められます。

染色体の欠失や重複は従来、染色体を横縞の縞模様に染め分けて顕微鏡下で検出する方法で行っていましたが、この方法では欠失や重複がおよそ1,000万塩基（10Mb）以上でないと検出することができませんでした。近年、次世代シーケンサーやマイクロアレイ染色体検査を用いることで、さらに精度の高い検査が実施できるようになりました。その結果、欠失や重複は特定の染色体のみに起こるわけではなく、染色体全体で認められ、異常の生じる部位ごとの症状も分かってきました。このようにして欠失や重複と、それに伴う臨床的所見との関連が報告され、異常の認められた遺伝情報はデータベース化されています。この中には共通する異常領域と特徴的な所見から複数例が報告され、独立した疾患に位置付けされているものから、稀な、もしくはこれまでに報告例のないものまでが存在します。従って、独立した疾患との関連が報告されていない欠失や重複があった場合、症例報告やゲノムデータベースを検索して、出現する症状などを個々に調べていく必要があるのです。東京衛生検査所では、染色体の部分重複・欠失が検出された際には、国内外の信頼性の高いデータベースを複数検索し、あった場合には検出された領域に含まれる疾患情報を担当医師に返却します。

全ての重複領域にある遺伝子と臨床所見との関連性が明らかになったわけではありません。また、欠失や重複が認められても、何の症状も示さない場合があります。これは欠失や重複する部位に生命活動や身体の形成に関わる重要な遺伝子が存在していない場合、もしくは遺伝子が存在していても病的所見を示さないタイプの遺伝子の場合があるためです。このような例として、8番染色体短腕（8p23.2）の重複は250万塩基（2.5Mb）に及ぶものでありながら、そこには１個のがん抑制遺伝子しか局在しないため、異常所見は認めず、正常変異と理解される場合もあります。欠損や重複が認められた場合、病的なものかどうかを鑑別する必要がありますが、これまでに報告例の無いものについては、その判断ができないこと、また欠失や重複との関連が不明の場合（variant of unknown significance: VUF = 意義不明変異）もあることをご理解いただきたいと思います。

全常染色体全領域部分欠失・重複疾患の報告例

染色体欠失

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染色体重複

（報告例は部分欠失・重複の一部です）
東京衛生検査所で使用している次世代シーケンサーは700万塩基以下の欠失・重複は検出できません。症候群の全ての症例を検出できるわけではありません。