微缺失综合征:第二多见的精神迟滞是迪乔治综合征(指定难病203)

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什么是微缺失综合征(指定难病)

微缺失综合征是染色体特定位置的基因缺失引起的疾病。

正如其名,这种缺失的尺寸较小,通常从50万个碱基对开始,通常由50万到300万个碱基对的缺失引起。根据缺失的尺寸和位置,评估各种伴有精神迟滞等发育迟缓的症状及其严重程度。此外,大多数微缺失综合征是自然发生的,与母亲的年龄无关。

因此,无论是年轻孕妇还是高龄孕妇,都有必要进行此类检查。

什么是常见的 22q11.2 缺失综合征(指定难病203)

22q11.2 缺失综合征(指定难病203)是由于22号染色体的特定区域缺失引起的遗传状况。该综合征已知会对免疫系统、心脏缺陷、面部特征差异等产生广泛影响。尽管这种疾病相对罕见,但对受影响的个人及其家人可能会造成严重影响。

通过Hiro诊所的NIPT检测的发现

在Hiro诊所进行的3,322例检测中,发现了5例与22q11.2 缺失综合征相关的基因异常。这比基于一般流行病学数据的每4000至6000人中有1人患病的比例要高,大约每600人中就有1人被检测出22q11.2 缺失综合征(指定难病203号)。这也支持了Hiro诊所提出的微缺失综合征检测的重要性。特别是对于被认为具有较高遗传风险的孕妇及其家人而言,这项检测提供了重要信息,使早期干预和准备成为可能。

Hiro诊所NIPT可以检测的微缺失综合征

22q11.2缺失综合征(指定难病203)据说是仅次于唐氏综合征的常见遗传病,这与其相对较好的生命预后有关。在Hiro诊所NIPT中,可以检测的包括22q11.2缺失综合征在内的微缺失综合征有以下四种。这些检测均在国内进行。目前,由于样本数量较少,尚未提供阳性评分。

病例名称22q11.2缺失综合征1p36缺失综合征史密斯-马吉尼斯综合征沃尔夫-希尔施霍恩综合征
患病部位22q11.21p3617p11.24p16.3
最高频率1/20001/50001/150001/50000
最低频率1/60001/100001/250001/96000

高级方案的优势所在。

高级方案在微缺失综合征检测的准确度方面与其他检测公司不同。以下是对检测最困难的22q11.2缺失综合征(迪乔治综合征)的说明。在高级方案中,对于22q11.2缺失综合征易缺失的区域(3Mb),其80%以上的区域均以超过100倍的深度进行测序。而在Illumina国外检测中,最大深度为3倍(估计值)。测序深度的不同直接影响检测的精度。常规测序通常需要30倍以上的深度,而高级方案中深度超过100倍。这种测序深度的差异导致了检测精度的不同,这就是为什么推荐高级方案的原因。

在近90%的迪乔治综合征中,最下面的绿色部分缺失。剩下的黄色和橙色情况分别是4%和3%,比例较低。已知在许多病例中,缺失区域小于3Mb。对比该区域的高级方案(Medicover方式)和Illumina方式(国外检测),可以看到测序深度的不同。蓝色柱状图的高度表示测序深度,长条代表100X以上,短条代表1X。国外检测在这个区域的测序深度虽然比通常的深,但也不过大约3X。通常是0.3X左右,所以已经做得很好了。由于原本使用的是全基因组的试剂盒,所以可以广泛且浅层地读取,但测序深度不够。因此,不适合检测这种细微的缺失。

以下说明,在 Illumina 海外检测中,FF(胎儿分数)低于 10% 的情况下,阳性结果会显示为阴性

Hiro诊所的检测记录

在过去进行的超过50,000例(※1)NIPT(新型产前诊断)中,Hiro诊所对4,543人(※2)进行了微缺失综合征的检测。

在这4,543人中,1人被明确诊断为22q11.2缺失综合征,通过侵入性检测证实阳性。此外,在5名无法判定的病例中,有2人进行了羊水穿刺检查,结果显示1人有22q11.2的重复,另1人为艾曼纽尔综合征。被诊断为艾曼纽尔综合征的病例显示染色体为47,XY,+der(22)t(11;22)(q23.3;q11.2),这意味着11号染色体的q23.3位置和22号染色体的q11.2位置发生了易位。22q11.2缺失综合征的检测是检测22号染色体q11.2位置的缺失,但由于该位置发生了变化,因此被检测为异常。这表明Hiro诊所的NIPT检测不仅可以检测微缺失,还可以检测与重复和易位相关的异常。其余3人在检测后未提供后续报告。此外,在被认为有高度阳性可能性(边界判定)的5人中,2人后来通过羊水穿刺检查被判定为阴性。其余3人未进行羊水穿刺检查。

22q11.2缺失综合征在一般人群中的发病率估计为每4,000至6,000人中有1人,是由22号染色体的微缺失引起的疾病。通过微缺失综合征的检测,有时可以发现与微缺失综合征同一区域的其他异常。截至目前,在4,543人中至少有3人通过侵入性检测检测到了22号染色体长臂11.2区域的缺失和重复。未来如果有未进行侵入性检测的人的数据报告,以下表格将会更新。

NIPT检测 羊水检测阳性 羊水检测阴性 未进行
阳性 1 1 0 0
高度阳性可能性 6 0 2 4
无法判定 5 2 0 3
样本数4543

作为参考,Hiro 诊所以前用 Illumina(Verinata)的 Sendout 进行了 1391 例测试,结果全部为阴性。这 1391 例测试均包含了微小缺失综合征的检测。

迪乔治
综合征
1p36
综合征
猫叫
综合征
沃尔夫-许尔许霍恩
综合征
安格尔曼
综合征
阳性数0例0例0例0例0例
总例数1391例

原因是,Illumina 的微缺失检测在缺失部位小于 3Mb 且 FF(胎儿分数)低于 10% 的患者中无法检测到缺失(引用自《Non-invasive prenatal testing (NIPT) by low coverage genomic sequencing: Detection limits of screened chromosomal microdeletions》)。大约 43% 的孕妇 FF 低于 10%,因此即使进行迪乔治综合征的微缺失检测,也有很高的可能性出现假阴性结果。对于 Verinata 检测(使用 Illumina 进行海外检测但符合上述条件的人),建议再次使用 Medicover 方式进行检测。

在迪乔治综合征中,用☆★表示。☆表示实际上是阳性但被诊断为阴性的病例。★表示正确诊断为迪乔治综合征的病例。纵轴表示缺失范围。大多数星星位于 3Mb 以下的位置,因为约 90% 的迪乔治综合征病例发生在 3Mb 以下。虚线曲线表示检测限界值。处于这条线以下的病例是伪阴性,也就是说,本应显示阳性的却显示为阴性。左下角的五颗☆是这种情况。在 14 个病例中,有 5 个病例为伪阴性,敏感度为 71.4%。

也就是说,在 Illumina 海外检测(非本公司)中,FF(胎儿分数)低于 10% 的情况下,阳性结果会显示为阴性

Hiro 诊所中 FF 的分布图如上所示。FF 在 10% 以下的比例为 43.7%(2024 年 6 月的数据)。也就是说,近半数的人 FF 低于 10%,因此迪乔治综合征的检测结果可能会出现假阴性。

22q11.2缺失综合征的概述与症状

22q11.2缺失综合征是一种由特定基因缺失引起的遗传疾病。该综合征可能导致胸腺和甲状旁腺发育不良、先天性心血管异常、典型面貌等多种症状。此外,还可能出现免疫系统问题、反复感染、因隐性腭裂导致的言语困难等特征性症状。

艾曼纽尔综合征的概述与症状

染色体的一部分与其他染色体交换位置的现象被称为易位染色体。由于这一现象,易位携带者在生育时有流产或不孕的风险。特别是11号染色体和22号染色体的易位可能导致艾曼纽尔综合征。通过特定的基因检测可以诊断出该综合征,该综合征会导致先天性心脏病、腭裂、肛门闭锁及肾脏畸形等严重的染色体异常。

22q11.2微重复综合征的概述与症状

22号染色体的一部分重复会导致这种综合征,80%的患者会出现先天性心脏病。法洛四联症是其中的代表性疾病,包括室间隔缺损和主动脉骑跨等。心血管疾病对生命预后有重大影响,同时还会出现其他多种临床症状。

【调查概述】
调查期间 2020年6月~2023年11月 2023年4月~2024年3月
调查机构
(调查主体)
东京卫生检验所
调查对象 在本院进行NIPT(新型产前诊断)检测的19岁至51岁人群
有效回答数
(样本数)
约50,000件 4,543件
※本新闻稿中的数据均来自本院的检测数据

四种微缺失综合征的缺失部位

四种微缺失综合征是由于「22号染色体的长臂」、「1号染色体的短臂」、「17号染色体的短臂」、「4号染色体的短臂」缺失而导致的疾病。下面列出的患病部位中,第一个数字是染色体的编号,后面的「p」指短臂,「q」指长臂。短臂是染色体的上半部分,长臂是染色体的下半部分。接下来的数字表示从中心着丝粒开始的编号位置。

如果结果呈阳性,我们建议进行羊水穿刺检查

如果检测结果呈阳性,我们强烈建议在本院进行羊水穿刺检查。羊水穿刺后,羊水需要进行微阵列或外显子组分析。
目前国内能够进行这种分析的检验所并不多。如果受检者希望进行分析以确认状况,请咨询本院,我们将为您推荐检验所。

包含微缺失综合征检测的Hiro诊所NIPT方案包括高级方案AM高级方案BM高级方案GM高级方案FM高级方案GM+高级方案FM+。详细信息请通过以下按钮查看检测方案页面。请阅读。