知的障害がわかる143種の微小欠失・重複疾患検査

ヒロクリニックはダウン症候群やディジョージ症候群以外にも知的障害を伴う143種の微小欠失・重複疾患検査ができます。妊娠10週目から行える簡単な採血で、赤ちゃんの将来に影響を与える可能性のある最も一般的な染色体異常をスクリーニングします。

遺伝子一覧 遺伝子一覧

①全常染色体全領域部分欠失疾患

②通常

③全常染色体全領域部分重複疾患

④スミス・マギニス症候群

ディジョージ症候群

染色体異常と遺伝性疾患の発生頻度

143種類ある微小欠失は、一般的に200〜300人に1人の割合で見られるとされています。つまり、出生の現場ではそれほど珍しいものではなく、決してまれな疾患ではありません。加えて、その全体の約75%では、重度の知的障害が認められるケースが多く、日常生活や学習に大きな支援が必要になることも少なくありません。

その中でも特に注目されるのが、自閉スペクトラム症(ASD)の合併です。全体の約20〜25%では、ASDの合併が高い割合で確認されています。また、30〜35%程度ではASDのリスクがやや高いとされ、行動面やコミュニケーションに軽度の特徴が見られる場合があります。一方で、残りの40〜50%はASDとの関連が稀であったり、十分に解明されていないケースです。

口唇口蓋裂については、全体の約10〜15%で高頻度に合併することが知られています。約50%前後のケースでは「ときどき見られる」「報告例が多い」とされますが、逆に30〜40%の範囲ではほとんど見られないか、報告が極めて少ないという特徴があります。

先天性心疾患はさらに頻度が高く、患者の3人に2人以上、つまり過半数で合併することが確認されています。心臓の構造や機能に関連する疾患が大部分を占め、早期の診断と適切な医療介入が必要になるケースも少なくありません。

歩行や運動発達については、全体の約80〜90%で何らかの遅れや困難が報告されています。そのうち約10〜15%は、歩行自体が難しかったり、長期にわたりサポートが必要になるケースです。ただし、軽度の遅れやほとんど影響がない例も一部存在します。

寿命に関しては、全ての症例で短命というわけではありません。半数以上の疾患では成人期まで生存される方の報告が複数あり、適切な医療や生活支援を受けながら長く暮らすことも十分可能であるとされています。

ダウン症候群
(Down Syndrome)
パトウ症候群
(Patau Syndrome)
エドワーズ症候群
(Edwards Syndrome)
クラインフェルター症候群
(Klinefelter Syndrome)
ターナー症候群
(Turner Syndrome, X0)
ディジョージ症候群
(DiGeorge Syndrome)
シャルコー・マリー・トゥース病 1A型
(Charcot-Marie-Tooth Disease Type 1A, CMT1A)
47,+21 47,+13 47,+18 47,XXY 45,X 46,del(22)(q11.2 46,dup(17)(p12)
推定発生率
(Estimated Incidence)
0.100~0.319% 0.020~0.029% 0.02% 0.200~0.100% 0.050~0.040% 0.014~0.026% 0.008~0.026%

Akhtar F, Bokhari SRA. Down Syndrome. [Updated 2023 Aug 8]. In: StatPearls [Internet]. Treasure Island (FL): StatPearls Publishing; 2025 Jan-. Available from: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK526016/ Orphanet. (Last updated September 2023). Trisomy 13 syndrome. Reviewed by Pr Alain VERLOES. Retrieved from https://www.orpha.net/en/disease/detail/3378 Williams GM, Brady R. Patau Syndrome. [Updated 2023 Jun 26]. In: StatPearls [Internet]. Treasure Island (FL): StatPearls Publishing; 2025 Jan-. Available from: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK538347/ Los E, Leslie SW, Ford GA. Klinefelter Syndrome. [Updated 2023 Nov 12]. In: StatPearls [Internet]. Treasure Island (FL): StatPearls Publishing; 2025 Jan-. Available from: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK482314/ Shankar Kikkeri N, Nagalli S. Turner Syndrome. [Updated 2023 Aug 8]. In: StatPearls [Internet]. Treasure Island (FL): StatPearls Publishing; 2025 Jan-. Available from: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK554621/ McDonald-McGinn DM, Hain HS, Emanuel BS, et al. 22q11.2 Deletion Syndrome. 1999 Sep 23 [Updated 2024 May 9]. In: Adam MP, Feldman J, Mirzaa GM, et al., editors. GeneReviews® [Internet]. Seattle (WA): University of Washington, Seattle; 1993-2025. Available from: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1523/van Paassen, B.W., van der Kooi, A.J., van Spaendonck-Zwarts, K.Y. et al. PMP22 related neuropathies: Charcot-Marie-Tooth disease type 1A and Hereditary Neuropathy with liability to Pressure Palsies. Orphanet J Rare Dis 9, 38 (2014). https://doi.org/10.1186/1750-1172-9-38

ヒロクリニックの「143種の微小欠失・重複疾患検査」は、胎児の染色体異常を詳しく調べる検査です。この検査では、遺伝情報を広範囲に分析する「全ゲノムシーケンシング(WGS)」という方法を使っています。

具体的には、母体の血液に含まれる胎児由来のDNA(cfDNA)と母体のDNAを取り出し、それぞれを増やして解析します。その際、「ペアエンドシーケンシング」という技術を使い、胎児のDNAと母体のDNAを区別して詳しく調べます。これにより、胎盤や母体に由来する染色体の異常が混ざっている場合でも、より正確に異常を検出でき、誤って「異常あり」と判定されるリスク(偽陽性)を減らすことができます。

また、この検査では、「Zスコア閾値」という基準を使って厳密に分析を行います。一般的なNIPT(新型出生前診断)の中には、一部の遺伝的特徴(SNP)に影響されやすいものもありますが、本検査ではその影響を受けにくく、公平で信頼性の高い結果を提供できます。

検査は妊娠10週目から受けられ、胎児の性別判定の精度は99.9%です。検査の分析は、アメリカの厳しい基準(CLIAやCAPの認定)を満たした専門の検査機関で行われています。

それでは、「微小欠失・重複」と「部分欠失・重複」の違いについて説明します。「微小」は、小さな異常(約200万~500万塩基の欠失・重複)を調べるものです。より細かく分析できますが、特定の異常に限定されます。一方、「部分」は500万塩基以上の大きな異常を調べるもので、すべての染色体を対象に広く異常を検出できます。それぞれに長所と短所があり、目的に応じた検査の選択が重要です。

両者の違い微小欠失・重複(このページで説明)部分欠失重複(別のページで説明)
疾患数最大143種類検査可能ほぼ無限
検査範囲最小50万塩基まで検出可500万塩基以上のみ検出
範囲最大143箇所の部分のみ常染色体
報告書記載対応した疾患名関連した遺伝子から推定される疾患名
微小欠失重複と部分欠失重複の違い

アメリカ産婦人科学会(ACOG)は、
母体年齢に関係なく、すべての女性に胎児の
遺伝的疾患に対する
染色体異常スクリーニングを提供することを推奨しています。

染色体異常を持つ赤ちゃんを出産するリスクは年齢とともに増加しますが、ダウン症の赤ちゃんの大多数は35歳未満の女性から生まれています。遺伝的疾患は家族内で遺伝することがありますが、ダウン症のような疾患はどの妊娠にも起こり得ます。

従来の母体マーカーを基にした出生前診断(例えば、トリプルテスト、クアッドテスト、統合テストなど)は、5%以上の高い偽陽性率を持っています。つまり、これらの検査で高リスクと診断された人々のうち、実際にダウン症であるのはわずか2~3%に過ぎません。残りの人々は完全に正常でありながら、高リスク群に誤って分類されてしまっているのです。

143種類の微小欠失・重複症候群リスト

143種類の微小欠失、重複症候群はヒロクリニックで検査可能な一覧です。海外での検査になるため、海外の検査所に到着後から2週間程度の時間が掛かります。これだけの数の微小欠失・重複症候群が知られべられるのはこのオプションだけになります。

1p32-p31 Deletion Syndrome
1p32-p31欠失症候群
1p36 deletion syndrome
1p36欠失症候群
1q41-q42 Deletion Syndrome
1q41-q42欠失症候群
1q43-q44 deletion syndrome
1q43-q44欠失症候群
2p12-p11.2 deletion syndrome
2p12-p11.2欠失症候群
2p16.1-p15 deletion syndrome
2p15-p16.1微小欠失症候群
2q duplication
2q重複症候群
2q13 deletion syndrome
2q13欠失症候群
2q13 duplication syndrome
2q13重複症候群
2q31.1 duplication syndrome
2q31.1重複症候群
2q31.1 microdeletion syndrome
2q31.1微小欠失症候群
2q33.1 microdeletion syndrome
2q33.1欠失症候群
2q35 duplication syndrome
2q35重複症候群
2q37 deletion syndrome
2q37欠失症候群
3pter-p25 deletion syndrome
3pter-p25欠失症候群
3p duplication
3番染色体短腕末端重複症候群
3q duplication
3番染色体長腕重複症候群
3q13.31 deletion syndrome
3q13.31欠失症候群
Dandy-Walker syndrome
ダンディー・ウォーカー症候群
3q26 microduplication syndrome
3q26微小重複症候群
3q29 deletion syndrome
3q29欠失症候群
4p duplication
4番染色体短腕重複症候群(4p重複症候群)
4p16.3 deletion syndrome
4p16.3欠失症候群(ウォルフ・ヒルシュホーン症候群)
4q21 deletion syndrome
4q21欠失症候群
4q duplication
4q末端部重複症候群
Axenfeld-Rieger syndrome, type 1 (RIEG1)
アクセンフェルト・リーガー症候群1型(RIEG1)
Distal chromosome 4q deletion
遠位型4q欠失症候群
5p duplication
5p重複症候群
5p13 duplication syndrome
5p13重複症候群
Cri-du-Chat syndrome
5p欠失症候群(猫なき症候群)
5q12 deletion syndrome
5q12欠失症候群
5q14.3 deletion syndrome
5q14.3欠失症候群(MEF2Cハプロ不全症候群)
Sotos syndrome
ソトス症候群
6p deletion
6p欠失症候群
6p22 microdeletion syndrome
6p22微小欠失症候群
6pter-p24 deletion syndrome
6番染色体短腕部分欠失症候群
6q11-q14 deletion syndrome
6q11-q14欠失症候群
6q15-q23 deletion syndrome
6q15-q23欠失症候群
6q24-q25 deletion syndrome
6q24-q25欠失症候群
6q25-qter deletion syndrome
6q25-qter欠失症候群
6q26-q27 deletion syndrome
6q26-q27欠失症候群
Chordoma
脊索腫
Greig cephalopolysyndactyly syndrome (GCPS)
グレイグ頭蓋多指合指症候群
7p22.1 microduplication syndrome
7p22.1微小重複症候群
7q deletion
7番染色体長腕欠失症候群(7q欠失)
7q11.23 deletion syndrome
7q11.23欠失症候群(遠位)
7q21-q32 deletion
第7染色体長腕欠失(7q21-q32欠失症候群)
7q31-q32 deletion
第7染色体長腕31-32欠失症候群(7q31-q32欠失)
7q36.3 duplication syndrome
7q36.3重複症候群
Currarino syndrome
クラリノ症候群
8p duplication
8p染色体重複症候群
8p23.1 deletion syndrome
8p23.1欠失症候群
8p23.1 duplication syndrome
8p23.1重複症候群
8q duplication
8q染色体重複症候群
8q12 microduplication syndrome
8q12微小重複症候群
8q22.1 deletion syndrome
8q22.1欠失症候群
8q22.1 duplication syndrome
8q22.1重複症候群
Langer-Giedion syndrome
ランガー・ギデオン症候群(LGS)
Trichorhinophalangeal syndrome type 2 (TRPS2)
毛髪・鼻・指節症候群II型
9p deletion syndrome
9p欠失症候群
9p duplication
第9染色体短腕重複症候群(9p重複症候群)
9p13 microdeletion syndrome
9p13微小欠失症候群
9p24.3 deletion syndrome
9p24.3 欠失症候群
9q33.3q34.11 microdeletion syndrome
9q33.3q34.11微細欠失症候群
Early infantile epileptic encephalopathy 4 (EIEE4)
早期乳児てんかん性脳症4型
Kleefstra syndrome 1 (KLEFS1)
クリーフストラ症候群1型
10p duplication
10p重複症候群
10p12-p11 deletion syndrome
10p11.21-p12.31微小欠失症候群
DiGeorge syndrome 2
ディジョージ症候群2型
10q22.3-q23.2 deletion syndrome
10q22.3-q23.2欠失症候群
Split-hand/foot malformation 3 (SHFM3)
裂手・裂足症3型
10q26 deletion syndrome
10q26欠失症候群
11p11.2 deletion syndrome
11p11.2欠失症候群(ポトッキ・シェイファー症候群)
11p13 deletion syndrome
11p13欠失症候群(WAGR症候群)
11q13.2-q13.4 deletion syndrome
11q13.2-q13.4欠失症候群
11q22.2-q22.3 microdeletion syndrome
11q22.2-q22.3微細欠失症候群
11q23 deletion syndrome
11q23欠失症候群
Jacobsen syndrome
ヤコブセン症候群(11q末端欠失)
12p duplication
12p重複症候群(12番染色体短腕重複)
12p12.1 microdeletion syndrome
12p12.1微小欠失症候群
12q14 microdeletion syndrome
12q14微小欠失症候群
12q15q21.1 microdeletion syndrome
12q15-q21.1微小欠失症候群
13q14 deletion syndrome
13q14欠失症候群
Distal chromosome 13q deletion
13q末端欠失症候群
14q duplication
14番染色体長腕重複症候群
14q11-q22 deletion syndrome
14q11-q22 欠失症候群
14q22 deletion syndrome
14q22欠失症候群
14q24.1-q24.3 microdeletion syndrome
14q24.1-q24.3 微小欠失症候群
Proximal chromosome 14q deletion
14q近位欠失症候群
Angelman syndrome
アンジェルマン症候群
Prader-Willi syndrome
プラダー・ウィリ症候群
15q13.3 duplication syndrome (BP4 to BP5) (gain)
15q13.3重複症候群
15q13.3 deletion syndrome (BP4 to BP5) (loss)
15q13.3 欠失症候群
15q14 deletion syndrome
15q14欠失症候群
Distal chromosome 15q deletion
15q末端欠失症候群
15q24 microdeletion syndrome
15q24微細欠失症候群
15q26 overgrowth syndrome
15q26過成長症候群
15q26-qter deletion syndrome
15q26-qter 欠失症候群
Levy-Shanske syndrome
レヴィ・シャンクス症候群
16p12.2-p11.2 deletion syndrome
16p12.2-p11.2欠失症候群
16p12.2-p11.2 duplication syndrome
16p12.2-p11.2重複症候群
16p13.11 deletion syndrome
16p13.11 欠失症候群
16p13.11 duplication syndrome
16p13.11 重複症候群
16p13.3 deletion syndrome
16p13.3欠失症候群
16p13.3 duplication syndrome
16p13.3重複症候群
Proximal chromosome 16q duplication
16q近位重複症候群
16q22 deletion syndrome
16q22欠失症候群
17p duplication
17p重複症候群(ポトッキ・ルプスキ症候群)
Smith-Magenis syndrome
スミス・マギニス症候群
Potocki-Lupski syndrome
ポトッキ・ルプスキー症候群
17p12 deletion syndrome
17p12 欠失症候群 (シャルコー・マリー・トゥース病1A型)
17p12 duplication syndrome
17p12 重複症候群(WBS)
Yuan-Harel-Lupski syndrome
Yuan-Harel-Lupski症候群 (YUHAL)
17p13.1 deletion syndrome
17p13.1欠失症候群
17p13.3 deletion syndrome
17p13.3 欠失症候群
17p13.3 duplication syndrome
17p13.3重複症候群
17p13.3 telomeric duplication syndrome
17p13.3 テロメリック重複症候群
17q12 deletion syndrome
17q12 欠失症候群
17q21.31 deletion syndrome
17q21.31 欠失症候群
17q23.1-q23.2 deletion syndrome
17q23.1-q23.2微細欠失症候群
18p deletion syndrome
18p 欠失症候群
Tetrasomy 18p syndrome
染色体18短腕重複症
18q deletion syndrome
18q 欠失症候群
Distal chromosome 18q deletion syndrome
18q末端欠失症候群(18q-症候群)
19p13 duplication syndrome
19p13 重複症候群
19q13.11 microdeletion syndrome
19q13.11 微小欠失症候群
20p duplication
染色体20p重複症候群
Alagille syndrome 1
アラジール症候群1型(ALGS1)
20p13 microdeletion syndrome
20p13 微小欠失症候群
21q22 deletion
染色体21q22欠失症候群
22q11.2 deletion syndrome
22q11.2欠失症候群
22q13 deletion syndrome
22q13欠失症候群(フェラン・マクダーミド症候群)
22q13 duplication syndrome
22q13 重複症候群
Xp11.22 duplication syndrome
Xp11.22 重複症候群
Xp11.23 microdeletion syndrome
Xp11.23 微小欠失症候群
Xp11.23-p11.22 duplication syndrome
Xp11.22-p11.23 重複症候群
Xp11.3 deletion syndrome
Xp11.3 欠失症候群
Xp21 deletion syndrome
染色体Xp21欠失症候群
Xp21.2 microduplication syndrome
Xp21.2 重複症候群
Xq21 deletion syndrome
染色体Xq21欠失症候群
Xq22.3 deletion syndrome
染色体Xq22.3欠失症候群
Xq27.3-q28 duplication syndrome
Xq27.3-q28 重複症候群
Xq28 deletion syndrome
Xq28欠失症候群
Q.この検査で21個のZスコアが利用されていますが、Zスコアとは何ですか?

A. Zスコアとは、あるデータが「普通の範囲」からどれくらい外れているかを示す数字のことです。たとえば、あなたがテストを受けたとして、普通の点数(平均)と比べて自分の点数がどれくらい良かったか、または悪かったかを計算する方法の一つです。

ここでの「データ」は、実際には生物の「遺伝子」や「タンパク質」といった情報です。これらの情報同士がどれくらい似ているかを計算するのにZスコアが使われます。

例えば、遺伝子やタンパク質の配列(並び方)が似ているかどうかを調べたい時に、Zスコアを使って、どれくらい「特別な一致」なのかを知ることができます。これを使うと、遺伝子やタンパク質が本当に似ているのか、それともただの偶然なのかを判断できるわけです。

簡単な例で言うと:

  • もしサイコロを100回振って、「1の目」が30回出たとしましょう。普通なら1が出る確率は1/6、つまり16回くらい出るはずです。それが30回出たなら、「これは偶然じゃないかもしれない」と思うはずです。Zスコアは、こんな感じで「偶然の範囲を超えているかどうか」を教えてくれるものです。

どうやって計算するか?

  1. まず、比較したい二つの配列(遺伝子やタンパク質の並び)を比べます。
  2. 次に、片方をランダムに並べ替え(シャッフル)て、その新しい並びと比較します。
  3. この「シャッフルして比較」の作業をたくさん繰り返して、どれくらい「普通の比較」ができるかの基準を作ります。
  4. 最後に、実際の配列のスコアがこの基準と比べてどれくらい高いか、または低いかを計算してZスコアが出ます。

Zスコアの良いところは?

  • Zスコアは「データベースが大きいか小さいか」に関係なく、正しく比較できることです。例えば、遺伝子を比べるデータベースが大きければE値という別の方法で計算しますが、E値はデータベースが大きければ大きいほど結果が変わってしまいます。しかし、Zスコアはデータベースの大きさに影響されません。これにより、どんなデータベースを使っても安定した結果を得ることができます。

Zスコアは、遺伝子やタンパク質の配列がどれくらい似ているかを評価するための方法です。この方法を使うことで、偶然に過ぎない一致か、それとも本当に意味のある一致なのかを見極めることができます。そして、データベースの大きさに関係なく正確に比較できるため、大規模な研究にも非常に便利です。

Hulsen, T., de Vlieg, J., Leunissen, J. A., & Groenen, P. M. (2006). Testing statistical significance scores of sequence comparison methods with structure similarity. BMC bioinformatics, 7, 444. https://doi.org/10.1186/1471-2105-7-444

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